Délocalisé en Amérique du Sud après l'annulation de l'édition 2008, le Dakar 2009 débarque sur les pistes d'Argentine et du Chili du 3 au 18 janvier. Les plaines de Patagonie, le désert d'Atacama ou le passage de la Cordillère des Andes, sont au programme des 530 équipages présents au départ de cette aventure inédite. Toute l'élite des rallyes raid s'est donné rendez-vous pour se mesurer sur les 9500 kilomètres - dont 5656 de spéciale.
| DATE | DÉPART | ARRIVÉE | SPECIALE | TOTAL |
| TOTAL | 5 652 km | 9 574 km | ||
| 03/01 | Buenos Aires | Sta Rosa de la Pampa | 371 km | 733 km |
| 04/01 | Sta Rosa de la Pampa | Puerto Madryn | 237 km | 837 km |
| 05/01 | Puerto Madryn | Jacobacci | 616 km | 694 km |
| 06/01 | Jacobacci | Neuquen | 459 km | 488 km |
| 07/01 | Neuquen | San Rafaël | 506 km | 763 km |
| 08/01 | San Rafaël | Mendoza | 395 km | 625 km |
| 09/01 | Mendoza | Valparaiso | 419 km | 816 km |
| 10/01 | Journée de repos | |||
| 11/01 | Valparaiso | La Serena | 294 km | 652 km |
| 12/01 | La Serena | Copiapo | 449 km | 537 km |
| 13/01 | Copiapo | Copiapo | 666 km | 686 km |
| 14/01 | Copiapo | Fiambala | 215 km | 680 km |
| 15/01 | Fiambala | La Rioja | 253 km | 518 km |
| 16/01 | La Rioja | Cordoba | 545 km | 753 km |
| 17/01 | Cordoba | Buenos Aires | 227 km | 792 km |
| 18/01 | Buenos Aires | Buenos Aires | 0 km | 0 km |